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Hinweis: Lokale Tags werden manchmal nicht gespeichert

Bei vereinzelten Datensätzen kann es dazu kommen, dass sich  die Lokalen Tags nicht ändern, bzw. neu anlegen lassen. In solchen Fällen passiert einfach „nichts“: Sie bleiben auf der Bearbeitungs-Seite.

Das kann daran liegen, dass in den eigentlichen Metadaten der Publikation ein formales Problem vorliegt. Das erneute Speichern, Einstellen oder Freigeben des Datensatzes mit den neuen Lokalen Tags scheitert dann. Diese Probleme könnten beispielsweise durch die Migration der Daten auf das neue System (INGe) entstanden sein: Es gibt z.B. noch immer eine kleine Zahl an Altdaten mit „kaputten“ IDs in den Affiliations. Im neuen System erzeugt dies nun eine Fehlermeldung.

Auf der Bearbeitungs-Seite der Tags ist diese Meldung aber nicht sichtbar – deswegen können Sie nicht gleich erkennen, wo das Problem eigentlich liegt.

Wenn Sie also auf so einen Fall stoßen, sollten Sie zunächst in die Bearbeitungs-Maske des gesamten Datensatzes wechseln und dort versuchen, den Datensatz zu speichern. Liegt hier tatsächlich ein Problem vor, bekommen Sie dann eine konrete Fehlermeldung.

PubMed Import

Um Datensätze aus der Meta-Datenbank PubMed in PuRe zu importieren, gibt es verschiedene Möglichkeiten. In diesem Artikel werden vier Möglichkeiten aufgelistet.
Für die kommenden Möglichkeiten brauchen Sie ein Literaturmanagement Programm wie zum Beispiel Zotero oder EndNote.

  • Nutzen Sie die Suche in EndNote für PubMed: Tools > Online Search > PubMed. Exportieren Sie im txt-Format mit dem Output-Style „EndNote Export“ die Datensätze und importieren Sie dieses Dokument in PuRe.
    • EndNote Export:

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Gruppenauswertungen mithilfe von EndNote

Für manche Auswertungen ist es interessant zu wissen, wie viele Publikationen in einem Department oder einer Gruppe entstanden sind und wie viele gemeinsam veröffentlicht wurden.
Um die entsprechenden Zahlen zu erhalten, besteht in PuRe die Möglichkeit Gruppen- und Department-Listen mithilfe der Suche zu generieren. Wir empfehlen dafür die Suchfelder „Organisation“ und „Collection“ kombiniert zu verwenden.

Komfortabler lassen sich solche Listen und Auswertungen mit dem Literaturmanagement-Programm EndNote generieren. Im folgenden eine Beschreibung der Vorgehensweise:

  • Exportieren Sie den Bestand, den Sie auswerten möchten, im EndNote Format aus PuRe. (PuRe exportiert im EndNote Format die Affiliation-Information.)
  • Importieren Sie den Export nach EndNote.
  • Erstellen Sie mit „Create Smart Group“ eine Gruppe für das jeweilige Department/Gruppe.
  • Stellen Sie folgendes ein: „Author Address contains“ „Gruppenbezeichnung“

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URL-Prüfung für externe Referenzen

Da MPG.PuRe (noch) keinen integrierten Linkcheck anbietet, hier eine Möglichkeit dies vor allem für externe Referenzen mithilfe eines Firefox-Addon durchzuführen.

Das benötigte Addon heißt LinkChecker und ist hier zu finden: https://addons.mozilla.org/de/firefox/addon/linkchecker/ Bitte beachten Sie, dass das Addon nicht kompatibel mit Firefox Quantum ist. Es funktioniert mit allen älteren Version von Firefox, wie zum Beispiel Firefox ESR. Achtung: Wenn Sie Firefox ESR installieren, wird die aktuelle Version auf Ihrem Rechner überschrieben.

Wenn Sie den LinkChecker erfolgreich installiert haben, fügen Sie ihn in Ihr Browser-Menü ein:

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Bekannter Bug: Output Format in der REST-Schnittstelle

Derzeit existiert bei der Auswahl eines Output Formats in der REST-Schnittstelle ein kleiner Bug: Sobald das Export Format CSL ausgewählt wurde, lässt sich nicht mehr das Output Format ändern.
Deshalb hier eine Anleitung um trotzdem an das gewünschte Output Format zu kommen:

  1. Wählen Sie zuerst zum Beispiel das Export Format APA aus und stellen Sie das Output Format auf das gewünschte Output Format zum Beispiel docx.
  2. Wählen Sie das Export Format CSL aus und dann einen Stil. Das Output Format sollte weiterhin docx sein.
  3. Mit Submit erhalten Sie die gewünschten Ergebnisse.

Aktueller Stand beim „Daten abholen“

In PuRe bestehen folgende Möglichkeit über den Import Daten von anderen Plattformen abzuholen (im englischen „fetch“):

Von diesen fünf Optionen funktionieren aktuell: Spires, eSciDoc und arXiv.

Bei BioMed und PubMed Central (PMC) ändert sich öfters ohne unser Wissen etwas auf der technischen Ebene, sodass PuRe keine Datensätze mehr abholen kann. Die Anpassungen, die nötig sind um wieder Datensätze abholen zu können, sind recht aufwendig. Erschwerend kommt hinzu, dass wir von den Änderungen nur erfahren, wenn das Abholen nicht mehr funktioniert.

Langfristig suchen wir nach einer generischen Lösung zum Abholen von Datensätzen.

Damit Sie weiterhin komfortabel Datensätze aus BioMed und PubMed Central in PuRe importieren können, empfehlen wir Ihnen, zum Beispiel das kostenfreie Zotero Plug-in für FireFox zu benutzen. Mit diesem können Sie ein RIS-Dokument erstellen, dass Sie dann in PuRe importieren können.

„Internal Server Error“ beim Aufrufen der Detailansicht

Aufgrund eines Fehlers in eSciDoc kann es in seltenen Fällen passieren, dass sich ein Datensatz nach der Bearbeitung in der Detailansicht nicht mehr öffnen lässt. Beim Aufruf der jüngsten Version erhalten Sie dann einen weißen Bildschirm mit der Meldung „Internal Server Error“.

Solange dieser Fehler nicht behoben ist, können Sie sich selbst mit einem Trick helfen und die Detailansicht wieder reparieren.

Bei der Erstellung oder Bearbeitung eines Datensatzes vergibt eSciDoc (Technisches Framework hinter PuRe) in diesen Fällen automatisch eine Affiliation-ID für den Urheber der Quelle. Die anderen Metadaten zum Urheber der Quelle bleiben aber leer.

Diese Konstellation führt dann bei der Darstellung in der Detailansicht zu einem Fehler und in PuRe kommt die „Internal Server Error“ Seite zum Vorschein.

Beheben können Sie diesen Fehler auf folgende Weise:

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Neuer Beispieldatensatz im CSL Editor

Um bei der Anpassung eines CSL Styles die Ausgabe an eigenen Beispielen zu testen, können Sie eigene Beispiele in den CSL Editor einpflegen.

Im Bereich „Visual editor“ besteht die Möglichkeit rechts oben bei „Example citations“ aus mehreren vorgefertigten Beispielen zu wählen: article-journal, book, report, usw. Sollten Sie ein Beispiel für ein anderes Genre benötigen oder an einem CSL Style mit ihrem eigenen zum Beispiel article-journal arbeiten wollen, können Sie ihn wie folgt einpflegen.

CSL Editor: Add new reference

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