Archiv der Kategorie: Allgemein

Probleme bei REST-Suchabfragen?

Nach dem letzten ElasticSearch-Update hat sich die Syntax von Rest-Suchabfragen an manchen Stellen verändert. Bestehende Abfragen (z.B. für Institutswebseiten) könnten deshalb nicht länger funktionieren.

In dem Fall erhalten Sie einen HTTP-Error 500 als Antwort.

Wir empfehlen, die verwendeten ES-Queries über die PuRe-Oberfläche einfach neu zu erzeugen. Das aktuelle ElasticSearch gibt immer die momentan richtige Syntax aus. Probleme bei REST-Suchabfragen? weiterlesen

PubMed Import

Um Datensätze aus der Meta-Datenbank PubMed in PuRe zu importieren, gibt es verschiedene Möglichkeiten. In diesem Artikel werden vier Möglichkeiten aufgelistet.
Für die kommenden Möglichkeiten brauchen Sie ein Literaturmanagement Programm wie zum Beispiel Zotero oder EndNote.

  • Nutzen Sie die Suche in EndNote für PubMed: Tools > Online Search > PubMed. Exportieren Sie im txt-Format mit dem Output-Style „EndNote Export“ die Datensätze und importieren Sie dieses Dokument in PuRe.
    • EndNote Export:

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URL-Prüfung für externe Referenzen

Da MPG.PuRe (noch) keinen integrierten Linkcheck anbietet, hier eine Möglichkeit dies vor allem für externe Referenzen mithilfe eines Firefox-Addon durchzuführen.

Das benötigte Addon heißt LinkChecker und ist hier zu finden: https://addons.mozilla.org/de/firefox/addon/linkchecker/ Bitte beachten Sie, dass das Addon nicht kompatibel mit Firefox Quantum ist. Es funktioniert mit allen älteren Version von Firefox, wie zum Beispiel Firefox ESR. Achtung: Wenn Sie Firefox ESR installieren, wird die aktuelle Version auf Ihrem Rechner überschrieben.

Wenn Sie den LinkChecker erfolgreich installiert haben, fügen Sie ihn in Ihr Browser-Menü ein:

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Aktueller Stand beim „Daten abholen“

In PuRe bestehen folgende Möglichkeit über den Import Daten von anderen Plattformen abzuholen (im englischen „fetch“):

Von diesen fünf Optionen funktionieren aktuell: Spires, eSciDoc und arXiv.

Bei BioMed und PubMed Central (PMC) ändert sich öfters ohne unser Wissen etwas auf der technischen Ebene, sodass PuRe keine Datensätze mehr abholen kann. Die Anpassungen, die nötig sind um wieder Datensätze abholen zu können, sind recht aufwendig. Erschwerend kommt hinzu, dass wir von den Änderungen nur erfahren, wenn das Abholen nicht mehr funktioniert.

Langfristig suchen wir nach einer generischen Lösung zum Abholen von Datensätzen.

Damit Sie weiterhin komfortabel Datensätze aus BioMed und PubMed Central in PuRe importieren können, empfehlen wir Ihnen, zum Beispiel das kostenfreie Zotero Plug-in für FireFox zu benutzen. Mit diesem können Sie ein RIS-Dokument erstellen, dass Sie dann in PuRe importieren können.

„Internal Server Error“ beim Aufrufen der Detailansicht

Aufgrund eines Fehlers in eSciDoc kann es in seltenen Fällen passieren, dass sich ein Datensatz nach der Bearbeitung in der Detailansicht nicht mehr öffnen lässt. Beim Aufruf der jüngsten Version erhalten Sie dann einen weißen Bildschirm mit der Meldung „Internal Server Error“.

Solange dieser Fehler nicht behoben ist, können Sie sich selbst mit einem Trick helfen und die Detailansicht wieder reparieren.

Bei der Erstellung oder Bearbeitung eines Datensatzes vergibt eSciDoc (Technisches Framework hinter PuRe) in diesen Fällen automatisch eine Affiliation-ID für den Urheber der Quelle. Die anderen Metadaten zum Urheber der Quelle bleiben aber leer.

Diese Konstellation führt dann bei der Darstellung in der Detailansicht zu einem Fehler und in PuRe kommt die „Internal Server Error“ Seite zum Vorschein.

Beheben können Sie diesen Fehler auf folgende Weise:

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Neuer Beispieldatensatz im CSL Editor

Um bei der Anpassung eines CSL Styles die Ausgabe an eigenen Beispielen zu testen, können Sie eigene Beispiele in den CSL Editor einpflegen.

Im Bereich „Visual editor“ besteht die Möglichkeit rechts oben bei „Example citations“ aus mehreren vorgefertigten Beispielen zu wählen: article-journal, book, report, usw. Sollten Sie ein Beispiel für ein anderes Genre benötigen oder an einem CSL Style mit ihrem eigenen zum Beispiel article-journal arbeiten wollen, können Sie ihn wie folgt einpflegen.

CSL Editor: Add new reference

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