Aktueller Stand beim „Daten abholen“

In PuRe bestehen folgende Möglichkeit über den Import Daten von anderen Plattformen abzuholen (im englischen „fetch“):

Von diesen fünf Optionen funktionieren aktuell: Spires, eSciDoc und arXiv.

Bei BioMed und PubMed Central (PMC) ändert sich öfters ohne unser Wissen etwas auf der technischen Ebene, sodass PuRe keine Datensätze mehr abholen kann. Die Anpassungen, die nötig sind um wieder Datensätze abholen zu können, sind recht aufwendig. Erschwerend kommt hinzu, dass wir von den Änderungen nur erfahren, wenn das Abholen nicht mehr funktioniert.

Langfristig suchen wir nach einer generischen Lösung zum Abholen von Datensätzen.

Damit Sie weiterhin komfortabel Datensätze aus BioMed und PubMed Central in PuRe importieren können, empfehlen wir Ihnen, zum Beispiel das kostenfreie Zotero Plug-in für FireFox zu benutzen. Mit diesem können Sie ein RIS-Dokument erstellen, dass Sie dann in PuRe importieren können.

„Internal Server Error“ beim Aufrufen der Detailansicht

Aufgrund eines Fehlers in eSciDoc kann es in seltenen Fällen passieren, dass sich ein Datensatz nach der Bearbeitung in der Detailansicht nicht mehr öffnen lässt. Beim Aufruf der jüngsten Version erhalten Sie dann einen weißen Bildschirm mit der Meldung „Internal Server Error“.

Solange dieser Fehler nicht behoben ist, können Sie sich selbst mit einem Trick helfen und die Detailansicht wieder reparieren.

Bei der Erstellung oder Bearbeitung eines Datensatzes vergibt eSciDoc (Technisches Framework hinter PuRe) in diesen Fällen automatisch eine Affiliation-ID für den Urheber der Quelle. Die anderen Metadaten zum Urheber der Quelle bleiben aber leer.

Diese Konstellation führt dann bei der Darstellung in der Detailansicht zu einem Fehler und in PuRe kommt die „Internal Server Error“ Seite zum Vorschein.

Beheben können Sie diesen Fehler auf folgende Weise:

  1. Öffnen Sie die vorherige Version des Datensatzes. Im PuRe-Link eines Datensatzes gibt die letzte Zahl die Version an. Im folgenden Beispiel führt der Link zu der aktuell letzten Version 5 des Datensatzes: http://pubman.mpdl.mpg.de/pubman/faces/viewItemOverviewPage.jsp?itemId=escidoc:2077472:5
    Stellen wir uns vor, dass die Version 5 kaputt ist, dann ersetzten Sie die 5 mit der 4, um zu einer Version zu kommen, in der der Datensatz noch intakt ist.
  2. In der Version 4 funktioniert sowohl die Übersicht als auch die Detailansicht, jedoch können Sie von hier aus den Datensatz nicht bearbeiten. Bitte wechseln Sie dazu zur Übersicht der Version 4 und wechseln Sie mithilfe des Hinweis auf die aktuelle Version.
    Verwechseln Sie von der Detail- zu Übersichtansicht

    Alternativ zu Schritt 1 und 2 können Sie sich auch einen anderen Datensatz anschauen und in die Übersichtsdarstellung wechseln. PuRe merkt sich diese Einstellung und wird alle folgenden Datensätze in der Übersicht anzeigen.

  3. Nun sehen Sie die Übersicht der Version 5 und können den Datensatz wieder bearbeiten, wenn Sie die nötigen Rechte dazu haben.
  4. Nun erstellen Sie einen weiteren Quellen-Autor mithilfe des + Knopfs und entfernen Sie mit dem – Zeichen den kaputten Autoren.
    Fehlerhaften Quellen-Autor entfernen

    Manchmal genügt erneutes Speichern der Datensatzes ohne den Quellen-Autor anzupassen.

  5. Speichern Sie den Datensatz erneut, wodurch eine neue Version entsteht.
  6. Dadurch sollte der Fehler behoben sein und Sie können den Datensatz auch in der Detailansicht sehen.

Es kann passieren, dass Sie weiterhin keinen Zugriff auf die Detailansicht der kaputten Version haben, jedoch ansonsten mit dem Datensatz weiterarbeiten können.

Neuer Beispieldatensatz im CSL Editor

Um bei der Anpassung eines CSL Styles die Ausgabe an eigenen Beispielen zu testen, können Sie eigene Beispiele in den CSL Editor einpflegen.

Im Bereich „Visual editor“ besteht die Möglichkeit rechts oben bei „Example citations“ aus mehreren vorgefertigten Beispielen zu wählen: article-journal, book, report, usw. Sollten Sie ein Beispiel für ein anderes Genre benötigen oder an einem CSL Style mit ihrem eigenen zum Beispiel article-journal arbeiten wollen, können Sie ihn wie folgt einpflegen.

CSL Editor: Add new reference

Wenn Sie auf „Example Citation“ klicken, öffnet sich ein Kontext mit drei „Citations“ Sie können ein beliebiges auswählen. In dem neuen Fenster können Sie den Bereich „Advanced“ öffnen und dort in das Text-Feld eine neue Referenz hinzufügen. Diese muss im .json-Format vorliegen. Eine entsprechende Datei können Sie zum Beispiel aus MPG.PuRe mit Zotero generieren.

Dazu öffnen Sie in MPG.PuRe einen Datensatz, den Sie im CSL Editor testen möchten. Diesen importieren Sie in Ihre Zotero-Bibliothek.  Mit einem Rechtsklick auf den importierten Datensatz öffnet sich das Kontextmenü, in welchem Sie „Ausgewählten Eintrag exportieren…“ bestätigen. Anschließend können Sie das Export-Format auswählen und entscheiden sich hier für „CSL JSON“. Anschließend werden Sie aufgefordert die entsprechende Datei zu speichern. Diese öffnen Sie anschließend mit einem Editor und kopieren den gesamten Inhalt heraus und in den CSL Editor in das oben beschriebene Feld. Nachdem Sie mit „Add new reference“ den Vorgang abgeschlossen haben. Wird das neue Beispiel mit angezeigt und Sie können es aus der Liste aus- und abwählen.

ORCID in CoNE

Mittlerweile hat sich bei der eindeutigen Identifizierung von Autoren die ORCID etabliert und wird bei einigen Personen-Einträgen in CoNE mit angegeben. Eine einheitliche Darstellung wurde bislang nicht für das Forscher-Portfolio vereinbart. Bis sich eine findet, sind hier ein paar Ideen für die Eintragung der ORCID Information gesammelt.

In CoNE eignen sich zwei Felder für die ORCID Information:

  • Identifier
  • Researcher URL
CoNE Eintrag bearbeiten

Im Identifier könnte als Value die ORCID Nummer, zum Beispiel 0000-0002-2661-8242, eingetragen werden. Als ID Type bietet es sich an „ORCID“ einzutragen.

ORCID Eintrag

Im Bereich Research URL soll in Value die ORCID URL eingetragen werden, zum Beispiel: https://orcid.org/0000-0002-2661-8242. Wichtig ist, dass „https://orcid.org/“ vor der ORCID-Nummer steht, damit das Feld korrekt verlinkt wird.
Das Feld Description sollte mit „ORCID“ befüllt werden. 

Ausschnitt aus einem Research Portfolio

Im Forscher-Portfolio des betreffenden Autors ist nun die Information der Researcher Homepage „ORCID“ mit dem ORCID Eintrag verlinkt und damit direkt anklickbar.

eSciDoc XML Import

Bei seltenen Gelegenheiten, wie zum Beispiel der Integration/Umzug einer Publikation von einem Kontext in einen anderen, kann ein eSciDoc-XML-Import nützlich sein. Dafür werden Datensätze aus MPG.PuRe im eSciDoc XML Format exportiert und anschließend in einen anderen Kontext neu importiert. Die ursprünglichen Versionen werden dann in der Regel (händisch) verworfen.

Derzeit wird bei einem eSciDoc-XML-Import der Datensatz-Permalink (das Handle) der ursprünglichen Publikation beim neuen Import mit übernommen. Somit haben zwei verschiedene Datensätze (trotzdem Dubletten) einen identischen Permalink, der in beiden Fällen weiterhin auf die erste Publikation auflöst.

Das ist ein unerwünschter Effekt, weshalb wir den Import in Zukunft anpassen werden. In der Zwischenzeit empfehlen wir dringend, die vorhandenen Datensatz-Handles (nicht die Versions-Handles) vor dem (Re-) Import aus dem XML zu löschen.

Dazu sind zum Beispiel folgende Arbeitsschritte nötig:

  1. Suchen Sie alle Dokumente, die importiert werden sollen. (Sie können die Ablage verwenden und dort Einträge sammeln, wenn Sie nicht alle Datensätze über eine Suchabfrage sammeln können.)
  2. Exportieren Sie nun alle Datensätze in dem „eSciDoc XML“ Format. Und speichern Sie das Dokument lokal auf Ihren Rechner.
  3. Öffnen Sie das heruntergeladene eSciDoc XML in einem Editor. Die weiteren Schritte werden Anhand des Editors Notepad++ durchgeführt.
  4. Suchen Sie über Search > Mark nach „<prop:pid>“ (mit diesem Tag wird das exportierte hdl eingeleitet) und markieren Sie alle Ergebnisse mit „Bookmark line“ über „Mark All“. Dadurch wird ein blauer Punkt der Zeile hinzugefügt.
  5. Entfernen Sie die markierten Zeilen über Search > Bookmark > „Remove Bookmarked Lines„. (Hier eine YouTube Anleitung für das Markieren und löschen von Zeilen in Notepad++ auf englisch: Link)
  6. Speichern Sie das bearbeitete Dokument auf Ihrem Rechner ab.
  7. Nutzen Sie den Import im Eingabe-Bereich wählen Sie dort den Kontext, in den Sie die Datensätze einfügen wollen. Anschließend wählen Sie das Importformat „eSciDoc“ und laden das in Notepad++ bearbeitete Dokument hoch.
  8. Deaktivieren Sie den Importparameter „bei Fehlern zurücksetzen“. So kann ein Import auch durchgeführt werden, wenn einzelne Datensätze nicht importiert werden können. Anderenfalls wird der Import beim Auftreten eines einzigen Fehlers komplett abgebrochen und zurückgesetzt.
  9. Wählen Sie die Option „Nicht nach Dubletten prüfen“ aus.
  10. Tragen Sie in das Feld „Name des Imports“ den Namen des Imports ein.
  11. Importieren Sie.
    Weitere Informationen zu dem Thema Import finden sie im Wegweiser Kapitel 3 Einstellungen für den Import festlegen.
  12. Sobald die Daten importiert wurden, können Sie diese mit einem Klick auf den Namen des Imports aufrufen.
  13. Alternativ können Sie im Filter unter „Meine Datensätze“ den Import wählen und sich die Daten anschauen.
  14. Gegebenenfalls muss der Import noch von einem Moderator  freigegeben werden.

Sollten Sie Hilfe bei einem der Schritte benötigen, können Sie sich an den Support wenden: pure-support@listsrv.mpg.de.

Web of Science Datenbanken Import

In der Rechercheoberfläche Web of Science (WoS) können verschiedene Zitationsdatenbanken ausgewählt werden. Der MPG.PuRe Import aus einigen Datenbanken kann zu fehlerhaften Links im Identifikator-Feld führen.

Ausschnitt aus der Web of Science Rechercheoberfläche

Der Web of Science Import zu MPG.PuRe ist speziell an die Zitationsdatenbank Web of Science Core Collection (früher Web of Science) angepasst.

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Namensänderung in CoNE

In dem kontrollierten Vokabular CoNE soll für jede natürliche Person maximal ein Eintrag angelegt werden.

Falls es zu einer Namensänderung kommen sollte – zum Beispiel durch Heirat, Scheidung oder anderes – gilt es auch den CoNE-Eintrag entsprechend anzupassen.

Wie Sie einen CoNE-Eintrag bearbeiten, können Sie im Wegweiser in Kapitel 18.8 nachlesen.

Vor der Namensänderung

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CSL-Export für Excel

Für manche Nutzer kann es hilfreich sein, sich Publikationslisten in einem Tabellen-Format, wie es Excel bietet, anzuschauen und dort auch gegebenenfalls auszuwerten.
Einen direkten Export in das Excel-Format ist aus verschiedenen Gründen derzeit in MPG.PuRe nicht möglich. Es gibt jedoch einen Weg, um sich Datensätze aus MPG.PuRe in Excel anzusehen. Mithilfe eines entsprechend angepassten Zitierstils ist es möglich Publikationen in ein  CSV (Comma-separated values) Dateiformat zu bringen und in Excel auszugeben.

Hier der Weg von MPG.PuRe zu Excel in vier Schritten:

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MPG.PuRe-Blog